慶余年神廟的最后結(jié)局是神廟被破壞了。在小說中,范閑和其他人最終找到了神廟,發(fā)現(xiàn)它實際上是一個軍事博物館,里面有大量的軍事武器、機器人和武功秘籍。神廟通過與范閑的交流,認(rèn)識到范閑來自一個更高級的文明,并決定將他留在神廟,以防止他加速文明的進化。然而,范閑不同意留在神廟,試圖離開。神廟派出使者去殺掉范閑,但最終被范閑的朋友五竹反殺。最后,范閑和其他人離開神廟,而神廟的大門被砸爛,機械也被破壞,只剩下一個解說員。因此,根據(jù)提供的信息,神廟在慶余年的結(jié)局中被破壞了。