慶余年的河底秘密是禁忌之門。葉輕眉在給范閑的書信中提到,太平別院湖底存在著禁忌之門,這是一切秘密的最終所在。禁忌之門可能是葉輕眉的實驗室,里面可能有現(xiàn)代化的高科技設備,如手機、導航、電腦等。范閑通過開啟葉輕眉留給他的箱子,發(fā)現(xiàn)了關于神廟的驚天秘密。具體來說,禁忌之門與范閑的來世之謎有關,范閑是一個上輩子得了絕癥的人,精神“穿越”到葉輕眉兒子的身上,成為了這個新世界的一部分。這實際上是上個文明的一種實驗。所以,慶余年的河底秘密是禁忌之門,其中可能包含著葉輕眉的實驗室和關于范閑來世之謎的信息。