碧云宗分為一殿兩堂四閣六院，一殿便是由宗主統(tǒng)管的碧云宗的中心，兩堂分別為專(zhuān)門(mén)制藥的碧草堂和專(zhuān)門(mén)制毒的永寧堂，四閣分別為客卿閣，膳食閣，禮樂(lè)閣和藏書(shū)閣。
六院則是碧云宗的弟子們住的地方。
與往生殿這類(lèi)的江湖勢(shì)力不同，碧云宗雖然也歸類(lèi)在江湖，但它卻是整個(gè)大周中唯一一個(gè)招收弟子的宗門(mén)勢(shì)力，聲明在外，幾乎無(wú)人不知。而在這一殿兩堂四閣六院中，最為主要的便是常年招收弟子的兩堂。
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