無間以天干地支來命名，總共分為子、丑、寅、卯、辰、巳、午、未、申、酉、戌、亥十二支，散落在整個三界之中。每支設(shè)有一名統(tǒng)領(lǐng)和兩名副統(tǒng)領(lǐng)，主掌一支的大小事務(wù)。
其中，兩名副統(tǒng)領(lǐng)一人負責主管情報的暗影，一人主管刺客的暗刺，而統(tǒng)領(lǐng)負責全局。
十二支彼此之間都是互不干涉，甚至互不認識，直屬于孫戊一人統(tǒng)領(lǐng)，為都督。
除此之外，無間還設(shè)有總部，主掌情報分析、歸檔和執(zhí)法，資源的調(diào)...